Los pastos marinos, tambien llamos Praderas de Thalassia, se encuentran distribuidos por todo el Mar Caribe. Son siete las especies presentes en este ecosistema de las cuales la hierba de Tortuga (Thalassia testudinum) es la más comun. Las Praderas de Thalassia se desarrollan en las lagunas que se forman entre las barreras coralinas y la playa o en los bajos arenosos de areas más protegidas como bahías o estuarios. Requieren para su desarrollo de suelos blandos o fangosos, agua de mar clara y sin sedimentos, salinidad que oscile entre 20 y 45 partes por millon, estar proteguidas de la accion directa del oleaje, se pueden desarrollar hasta profundidades de 20 m, se reproducen por rizomas y son muy delicadas en su sistema radicular ya que su deterioro detiene totalmente su crecimiento.

En los fondos arenosos las Praderas de Thalassia forman parches de mayor o menor tamaño que junto con otras algas del bentos sirven de refugio a muchas especies marinas de peces, moluscos como el gran Botuto, crustáceos como la Langosta, esponjas, etc. e incluso las Tortugas Verde y Carey.

Las Praderas de Thalassia mantienen muchas especies de animales herbívoros como el manatí (Trichechus manatus), tortuga verde (Chelonia mydas), pez loro (Sparisoma radians).

Entre las muchas especies residentes o visitantes de las Praderas de Thalassia estan el Botuto (Strombus gigas), la Ceritia de la hierba (Bittiolum varium), la Estrella de Mar (Oreaster reticulatus).

Los erizos blanco (Tripneustes ventricosus) y el de espinas largas (Diadema antillarum) junto con los corales.

Por otra parte, la mayor diversidad de fauna y flora se encuentra en el diminuto plancton en suspensión, donde son dominantes los dinoflagelados que frecuentemente presentan el fenómeno de la luminiscencia, espectáculo nocturno en el mar de inolvidable belleza donde cualquier movimiento del mar este es iluminado con la fosforescencia de estos organismos.